面向对象多态性 湖南汉族集体STR基因座D1S1656多态性调查

黄健+++吴华+++蔡金洪+等

[摘要] 意图 为了取得湖南汉族人群D1S1656基因座遗传多态性信息及其法医学参数。 办法 选用Powerplex 21 system试剂盒检测湖南汉族无关个别451例，对D1S1656基因座进行Hardy-weinberg平衡查验，并核算其法医学参数。 成果 D1S1656基因座契合Hardy-weinberg平衡（P>0.05），共发现16个等位基因，个别辨认力（Power of Discrimination，DP）0.954，非父扫除率（Power of Exclusion，PE） 0.667。 定论 D1S1656基因座在湖南汉族人群中具有杰出多态性，有法庭科学使用价值。

[关键词] 法医证据；D1S1656；遗传多态性；湖南汉族人群

[中图分类号] DF795.2 [文献标识码] B [文章编号] 1673-9701（2014）26-0131-02

跟着法庭科学亲权判定、个别辨认技能的不断深入，为了到达更高的系统效能，商品化试剂盒所选用的短串联重复序列（short tandem repeats，STR）遗传符号数目不断添加。开始商品化试剂盒由美国FBI认可的13个联合索引系统（Combined DNA Index System，CODIS）STR基因座组成，之后发展到2000年之后遍及选用的16个STR基因座[1，2]。2011年美国promega公司推出PowerPlex 21 System（PP21）商品化试剂盒，其STR基因座添加为21个，该系统引进了新的STR基因座D1S1656。关于新引进的基因座D1S1656，尽管2000年之后相继有一些该基因座集体多态性的报导[3-6]，但是相关于其他STR基因座，该基因座的集体多态性研讨适当有限。自2011年至今，每年司法部上海司法技能研讨所展开的全国法医DNA实验室才能验证，均未供给可以用于核算该遗传符号的法医学个别辨认力及非父扫除率数值，信息的缺乏导致DNA实验室间比对困难。因为D1S1656基因座的集体数据缺乏，当亲权判定评价系统效能及核算个案的亲权指数时，常常只能粗略地参阅美国亚裔人或是我国某一区域人群的数据。

为了可以逐步弥补、完善D1S1656基因座在我国集体中的等位基因信息，促进亲权判定及个别辨认的谨慎性，本次研讨查询了湖南集体D1S1656基因座的遗传多态性，为往后法医学使用供给参阅依据。

1材料与办法

1.1 临床材料

2013～2014年期间湖南区域汉族无关个别血痕451例（男313例，女138例），均知情赞同，一切样本均来源于湖南省脑科医院法医证据科。

1.2 仪器与试剂

ABI公司9700 PCR扩增仪，3130遗传剖析仪，GeneMapper 3.2基因剖析软件；所用扩增试剂盒为 promaga 公司的Plower Plex 21（批号0000094593），电泳为POP4别离胶（批号：1401130）。

1.3 DNA提取及检测

DNA提取选用chelex-100法，PCR系统及条件依据试剂盒阐明。10 μL系统：Master mix 2 μL，引物2 μL，模板DNA 2 μL（2 ng），去离子水4 μL。PCR 的反响循环参数为：96℃，1 min；94℃，10 sec；59℃，60 sec；72℃，30 sec，29个循环；60℃ 10 min。

1.4统计学剖析

Hardy-weinberg 平衡查验及法医学参数多态信息量（polymorphism information content， PIC）；观测杂合度（observed heterozygosity，Ho）；匹配概率（Matching probability， PM）；个别辨认力DP[7]；非父扫除率PE的核算选用Powerstats V12.xls软件[8]。

2 成果

D1S1656基因座在无关个别中契合Hardy-Weinberg平衡（P>0.05），湖南汉族人群451个无关个别中共检测到16个等位基因，其间等位基因15散布频率最高为0.284；等位基因10、14.3、15.3、19.3均检测到其频率均为0.001；等位基因18、19其频率也较低，均小于0.01。湖南汉族人群D1S1656基因座多态信息量PIC为0.820，个别辨认力 DP 为0.954， 非父扫除率PE 为0.667。

3 评论

STR基因座因为其信息含量丰厚已成为法庭科学亲权判定及个别辨认首选遗传符号。但是STR基因座相关于刺进/缺失（Insertion/Deletion， InDel）和单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）其突变率较高，约为0.002[9]，而且跟着亲权判定技能规范要求日益谨慎，法庭科学所选用商品化试剂盒中所含有的STR基因座近两年已到达20个以上。2011年，美国研发了21个基因座的商品化试剂盒PP21，并于2012年进入我国法庭科学实验室。一般一个STR基因座要科学、精确地使用于法医学范畴，有必要首要树立该遗传符号集体遗传数据。针对PP21试剂盒中引进的新基因座D1S1656，国内先后报导过浙江汉族人群、北京区域汉族人群多态性查询[5，6]，但目前为止其不同区域集体的多态性研讨仍是适当有限，常常使其实践使用受限。

D1S1656基因座坐落1号染色体，系四核苷酸重复STR基因座，为了研讨该基因座在湖南汉族人群中是否具有较丰厚的多态性并评价其法医学使用价值，本次研讨选用商品化试剂盒PP21对基因座D1S1656进行湖南汉族人群多态性查询。研讨成果发现该基因座在湖南汉族人群中共检测到16个等位基因，比较于浙江汉族人群中所发现的13个等位基因[5]，湖南汉族人群中还检测到等位基因10、15.3和19。其间10、14.3、15.3、19.3表现为稀有等位基因，频率均为0.001。本研讨湖南汉族人群D1S1656基因座个别辨认力DP为0.954、非父扫除率PE 为0.667，略高于浙江汉族人群的DP 0.945、PE 0.650[5]，湖南汉族人群显示出更丰厚的信息含量。一起D1S1656基因座法医学各参数值高于法医学常用STR基因座系统的均匀参数值[1，2]，标明该基因座含有较丰厚的信息量，具有杰出的法医学使用远景。endprint

[参阅文献]

[1] 杨立，常云峰，蔡继峰，等. 湖南汉族人群17个STR 基因座遗传多态性[J]. 我国法医学杂志，2011，26（5）：399-400.

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[4] Stanciu F1，Vladu S，Cu■r V，et al. Genetic parameters and allele frequencies of five new European Standard Set STR loci（D10S1248，D22S1045，D2S441，D1S1656，D12S 391） in the population of Romania[J]. Croat Med J，2013，54（3）：232-237.

[5] 郝宏蕾，吴轻轻，吕德坚，等. 浙江汉族人群D1S1656、SE33和D2S1338基因座的遗传多态性查询[J]. 刑事技能，2012，2：53-55.

[6] 邹凯南，欧元，姜伯玮，等. 北京区域汉族人群6个STR基因座的遗传多态性[J]. 刑事技能，2009，1：19-22.

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[8] Promega Biotech Co，Ltd. PowerStats V12.xls[EB/Ol]. http：//www.promega.com/ geneticidtools/powerstats/.

[9] Leopoldino AM，Pena SD. The mutational spectrum of human autosomal tetranucleotide microsatellites[J]. Hum Mutat，2003，21（1）：71-79.

（收稿日期：2014-06-19）endprint

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